『シリアル・エクスペリメンツ・レイン』において、14歳の岩倉玲音は内向的な少女であり、社交に苦手としていた。彼女は既に死亡した同級生の四方田千砂から思いがけずメールを受け取る。テクノロジーに関する経験がほとんどないにもかかわらず、玲音はメッセージを開き、ワイアードと呼ばれるインターネットに似たデジタルネットワークに引き込まれる。この出来事が彼女の人生を変え、神秘的な謎に直面することとなる。メン・イン・ブラックと呼ばれる人物たちが彼女の周りに現れ始め、彼女自身も完全には把握していない彼女の人生の詳細について尋問する。物理世界とサイバースペースの境界が曖昧になるにつれて、玲音はますます超現実的なシナリオに巻き込まれ、それらはアイデンティティ、意識、現実の本質に挑戦する。テクノライズの生みの親である小中千昭が監督するこの心理的かつ前衛的なミステリーは、玲音の重要な選択を追い、その選択は現実世界とワイアードの両方に影響を与える。一方の領域が消え、もう一方が現れる中で、これらの相互接続された現実の完全な意味を理解できるのは玲音だけである。